1996年3、4月间，白宝山（丁勇岱 饰）连续在北京犯下重案，事情惊动了党中央，公安部责成北京市公安局限期破案。白宝山原本有一个幸福家庭，因一念之差走向歧路，83年“严打”期间被判刑劳改。伹十余年的牢狱生活非但没让他改邪归正，反而使他性情更加走向极端。出狱后，他密谋实施了袭击军警、抢夺枪支，所犯罪行为北京建国以来罕见。手中有枪的白宝山变的异常凶残，他的两个患难狱友就因和他发生几句口角，即被他送上了黄泉路，连同案犯吴子明也被他残忍杀死。之后，迫于警方压力，他逃往西北地区，一连杀死了7名无辜群众，正义的天网拉开了......
　　本剧根据真实故事改编。

　　该剧选取原著中涉及的改革开放20年来中国法治进程中具有一定代表性的20宗真实个案，以中国女检察官第一人称的讲述为主线，从检察官的社会责任感以及女性所特有的人性化的独特视角，以电视笔记体的新颖表现形式，形象而生动地再现女检察官的办案过程，深度透视犯罪案件后面的积弊、暗流和根源，以期引发全社会的关注与思考。该片将凸显检察机关“强化法律监督，维护公平正义”的工作主题，注重社会主义法治理念的传播，为减少和遏制犯罪，为让我们的生活更加和谐、安宁、祥和，作出积极的努力。

　　某夜，中国警方一举破获了由香港黑社会和大陆犯罪分子内外勾结的走私交易。这次行动由“雷霆行动组”直接指挥，生擒香港黑社会四龙帮老大陈雄，故意放走了四龙帮原老大龙山，引起了四龙帮与龙山派系的内讧。龙山迫于各种压力，投诚大陆警方，要求警方保护他和女儿的生命安全。化名为韩卫东、何良和“雷霆行动组”成员和化名为尤婷香港女警官分别从三个不同的角度潜伏介入香港“黑仔联盟”，由此揭开了“雷霆行动”的序幕。 由刘志豪指挥的“雷霆行动”，意在破获香港黑社会中组织严密，类似恐怖组织的黑仔联盟，陈雄和龙山均系黑仔联盟的骨干。陈雄顽固不化，把交待视作交易。因其罪行特别严重，被地方法院处以极刑。龙山虽是投诚，但也只是用一些黑仔联盟的毛皮搪塞警方。刘志豪欲擒故纵，引蛇出洞，放龙山回香港。
　　龙山回到香港，黑仔联盟和四龙帮哗然。黑仔联盟的神秘首领侯爷，一方面纵容挑唆陈雄的弟弟，四龙帮新老大陈彪和龙山火拼仇杀；一方面秘密派人对韩卫东和龙婷秘密调查，同时对陈彪的拜把子兄弟，死在旺角海湾的何三拐的弟兄何良暗查明访。一时间冷艳性感的女郎叶云反手为云，覆手为雨，忙得不亦乐乎。叶云明是陈彪的情人，暗是侯爷的鱼鹰，叱咤黑幕风云。
　　龙山摆脱警方的监视，私下到红吧与美国康寿公司的道瑞会晤，不期撞上陈彪。陈彪正欲找龙山算帐，报陈雄在大陆被杀之仇（实际上陈彪篡夺其哥而出卖陈雄），不料龙山并没摆脱女警官龙婷的监视，尤婷的出现打乱了龙山和陈彪的计划。龙山从红吧后门逃走，尤婷寡不敌众，落入陈彪魔掌。
　　刘志豪和香港国了示刑警督察屠法中为营救尤婷，派韩卫东前去绑架叶云，以此人质互换，警方也因此牵出红吧和叶云两条线。警方洞悉龙山的狡诈之时，正值龙山的弟弟魏甫在家族内政变，不料魏甫反而死于魏亦凤之手，警方逮捕了龙山。
　　龙山的逮捕引发了黑仔联盟一系列行动，告诉了警方龙山在黑仔联盟中的作用，韩卫东和尤婷几经渗透，按行动组计划，韩卫东离开魏亦凤跟随叶云，尤婷仍留在魏亦凤身边。陈彪为了抢夺龙山的地盘和魏亦凤闹得不可开交，而此时侯爷致力于的大“CASE”正在悄悄进行。
　　时值美国康寿公司道瑞因谋杀入狱。刘志豪和吴涛涛赴美国，在美国旧金山FBI的支持下密访并制服了旧金山华人黑社会的老大弗来西斯·陈，弗来西斯·陈出于无奈，同意协助大陆警方，于是刘志豪以美国通达国际贸易总公司的总经理身份来到了香港。迎接他的是魏亦凤，侯爷为了独揽此笔生意，在机场绑架刘志豪，用汽车炸弹炸死了前来开车的尤婷。
　　警方摸清了黑仔联盟的基本内幕，却发生了两个潜伏者的对持。刘志豪机智摆脱了侯爷的监视，冒险约见两名潜伏者，当两名潜伏者相遇对上暗号彼此大惊，原来是在卧底时结下宿怨的韩卫东和何良。
　　缅甸警方发现大批自杀身死的“新圣教社”的信徒，这些死者内脏全被掏空，正源源不断送往南海某渔产码头的冷藏库。刘志豪与侯爷达成协议，警方布下天罗地网，殊不知还有一条暗线在活动……

　　《大漠高墙》是反映监狱改革和调整的历史大背景的力作。该剧以20世纪初新疆监狱的改革发展为主题，以监狱高墙内外平凡的故事为线索，展开一名年轻的机关民警萧凡自愿到地处大漠中库亚西监狱担任监区长，文明执法，寓情于教，推出亲情帮教、视频网络，组建女警中心等改革举措，促进监区面貌发生变化的故事情节。该剧在改造、教育、回归、心理等因素情节脉络中展示观念的冲突和戏剧冲突，体现了改革与保守、创新与传统思想的激烈碰撞，从新世纪的监狱调整步伐中演绎了跌宕起伏的戏剧冲突，塑造了耳目一新的监狱民警影视群象。从一个侧面讴歌了我区监狱民警肩负历史使命，勇于探索创新，严格文明执法的高尚情操和无私奉献的情怀。《大漠高墙》还从监狱民警形象在生活和工作、亲情与原则的两难抉择中，展示监狱民警对党的监狱事业不懈追求和忠诚执着，在重铸罪犯灵魂的同时，改造自然、改造环境，使大漠戈壁发生巨大变化，监管手段日趋完善，加快了现代化文明监狱的创建步伐。