近未来，被世人称为“美杜莎”的后天性细胞硬化症候群（ACIS）泛滥全球，被感染者经过30~60的潜伏期后，在短短的12天内就会病发身亡。死时全身石化，其状恐怖。由于没有任何的特效药和对峙办法，人类世界陷入一片末日般的恐慌之中。就在此时，科学研发企业维纳斯门宣称可通过冷冻睡眠的办法为人类保留生命的希望，但是全球仅有160人有资格走入冷冻胶囊。女孩一色霞（花泽香菜 配音）幸运地成为160人中的一员，但是她也要被迫和相亲相爱的双胞胎姐妹生离死别。当小霞再次醒来时，发现维纳斯门总部情景怪异，接着一群奇怪生物袭击了这些人，最终只有极少数人侥幸活了下来。等待小霞的，将会是怎样残酷的命运……本片根据岩原裕二的同名原著漫画改编。

故事发生在一个与世隔绝的村庄——外场村。多年以来，村庄一直维持着最为古老的殡葬方式——土葬。这为一种名叫“尸鬼”的怪物的生成提供了得天独厚的良好环境。尸鬼，僵尸的一种，它们身强体壮但惧怕阳光，靠吸食人类血液为生，同时以将普通的人类变成尸鬼来扩充己方的实力，它们的目的只有一个，那就是彻底占领外场村。奇怪的事情在村子各处隐秘的发生着，谁也没有将它们联系到一起，当恐惧爆发的时候，一切都已经为时已晚。结城夏野（内山昂辉 配音）是第一个发现尸鬼存在的人，而当他被尸鬼攻击后，却变成尸鬼的亚种“人狼”，人狼除了身体素质强于常人外，与人类无异，因此，人狼成为了唯一能够和尸鬼抗衡的存在。在这个小小的村落中，在恐惧与鲜血的包围下，尸鬼的领袖桐敷沙子（悠木碧 配音）和人狼的领袖结城夏野之间，淳朴的村民和嗜血的魔物之间，即将展开一场惨烈的战争。

小泽晴香（藤村歩）是一个个性独立坚强的少女，可是外表开朗的她却隐藏了一段不为人知的悲惨过去，终日被愧疚之情困扰的她，在某一天敲开了改变她命运的大门。在电影研究会中，晴香遇见了谜一般的男子齐藤八云（小野大辅 配音），黑发赤眼的他便是传说中左眼能够看到死灵的灵能力者。在八云的帮助下，一直以来为了姐姐的死而自责的晴香被治愈了，同时，八云古怪的作风和善良的内心也渐渐吸引了她的注意。在校园中，发生着各种各样的自然科学无法解释的灵异事件，凭借着八云的特殊能力，晴香和八云开始逐个的揭露其真相。而在破案的过程中，八云扑朔迷离的身世也逐渐的浮出了水面。

在“TokyoExplosion”的未知灾难背后，有一名暗中活跃的契约者——代号“黑”，被称为黑色死神的男人。制造了与“组织”敌对的事件，黑和他的同伴，身为DOLL的银一起踏上了逃亡之路。他们一边击退组织派来的刺客，一边向南方前进。在漫无尽头孤独的逃亡旅程中，两人可以信赖依靠的，只剩下彼此而已……夏日的阳光下，黑和银寻得了片刻的休憩。但是，幸福的时间并未长久，深重冷酷的黑暗已悄悄迫近。本是失去自我的DOLL的银在与黑共处的日子里，渐渐开始表现出自己独立的意志。对银的变化感到困惑焦躁的黑，却并不明白这意味着怎样的事实对于发生着变化的自己，银也非常苦恼。想和黑在一起，但是这样下去的话……以银为目标的狙击者出现，新的斗争也被点燃。命运的选择再次降临到黑的头上。几乎把两人之间的羁绊撕裂的悲剧的序幕，正悄无声息的开始上演……